Flowjo

Flowjo官网,資料可視化,流式細胞資料

Flowjo是什么

FlowJo 是一款流式細胞仪資料分析軟體，它被广泛用于對流式細胞仪生成的資料进行處理、可視化和解釋。FlowJo 的主要功能包括資料清洗、流程分析、資料可視化、种群比較和統计分析等。用户可以透過 FlowJo 對細胞表型、功能和亞群进行分析，并生成高质量的圖形和報告。FlowJo 提供了强大的資料分析工具、多种圖表和圖像選项、客製化的資料筛選和控制、高級統计方法等功能。同时，FlowJo 还支持插件擴展，以滿足不同用户的需求。该軟體在生命科学研究领域，特别是免疫学、細胞生物学和臨床研究中得到了广泛应用。FlowJo 不仅适用于單个样本的資料分析，还能處理多重样本、复雜的實验設计和大規模資料集。它提供了直觀友好的界面，使用户能够方便地導入、管理和分析流式細胞仪資料。需要注意的是，FlowJo 是一个商業軟體，用户需要購买許可證才能使用其完整功能。

Flowjo官网：https://www.flowjo.com/

Flowjo單荧光流式結果分析与作圖

1.首先打開FlowJo軟體，并將流式結果拉进打開的對话框（p2）
2.選中結果双擊，對其进行坐标参數設置（p3）
3.点擊T还可以對坐标數值进行调節（p4）
4.以空白组為基准設置线型門（p5）
5加入layout editor进行作圖（p6）
6.刚加入时每组会在同一位置，將他们分開查看，要做叠加圖的话，就可以再把它们拽到第一组上層，出现藍框后，松開就可以叠加（p6）
7.圖片的叠加形式可以透過右键点擊圖片来进行選择（p7）
8.獲得四种不同形式圖（p8）

Flowjo分析細胞周期

細胞周期是指以有丝分裂方式增殖的細胞从亲代分裂結束到子細胞分裂結束所經歷的过程。通常由G0/G1期、S期、G2期和M期组成。G1期：細胞開始RNA和蛋白质的合成，但DNA含量仍保持二倍体。S期：DNA開始合成，这时細胞核内DNA的含量介于G1期和G2期之间。当DNA复制結束成為4倍体时，細胞进入G2期。G2期的細胞繼續合成RNA及蛋白质，直到进入M期。因此，單純从DNA含量無法区分G2期和M期。一旦有丝分裂發生，細胞分裂成两个細胞，这两个細胞或者进入下一个細胞周期，或者进入静止期（G0期），而G0期从DNA含量上同样無法与G1期区分。因此，整个复制周期可以描述為G0/G1、S、G2/M期。透過核酸染料PI标記DNA,并由流式細胞仪进行分析，可以得到細胞各个时期的分布状態，计算出G0/G1%、S%、G2/M%，了解增殖能力，在肿瘤病理学研究中，通常以S期細胞比率作為判斷肿瘤增殖状態的指标。
細胞周期检测的原理：
核酸染料可以与DNA分子特異性的結合，細胞周期检测中PI最為常用。PI為插入性核酸荧光染料，能選择性的嵌入核酸DNA和RNA双链螺旋的碱基之间与之結合，其結合的量与DNA的含量成正比例關系，用流式細胞仪进行分析，就可以得到細胞周
FlowJo分析細胞周期教程
首先在我们的電腦上安装FlowJo X（需要安装軟體请關注微訊號，留言回复“軟體”索取）
打開上圖的第二个圖标，直接拖入需要分析的流式周期fcs文件
双擊打開要分析的文件，会出现以下界面。X轴選择FSC-A，Y轴選择SSC-A。请注意标红框的位置要選择Linear Axis。
在文件左上区域根据習慣選择一种圈門方式，圈出符合分析条件的細胞團
双擊細胞團，进入一个新的界面。用方框的門圈出single cells。
返回主界面，右键single cells，選择cell cycle。
出现如下界面，單擊OK。
进入結果分析界面，選择通道PE-A
然后就得到了彩色的周期圖。
返回主界面，選择如下圖标，將cell cycle直接拖入右邊對话框，再儲存成我们需要的文件格式。
如果需要批量分析的话，可以選中如下文件，直接滑鼠拖入下一个文件中。導出文件时，也可以批量導出。