ncbi官网入口网址,PubMed,Gen,BLAST,geo資料库,生物信息学資源中心
ncbi简介
NCBI代表美国国家生物技術信息中心(National Center for Biotechnology Information),是美国国立衛生研究院(NIH)下属的一个部門。NCBI是一个重要的生物信息学資源中心,旨在收集、存儲和分發生物学和生物医学领域的大量資料和信息。
ncbi官网: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
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NCBI的主要任務是提供广泛的生物信息学工具和資料库,以支持科学研究、生物医学研究和基因组学等领域的發展。
它提供了許多重要的資料库和工具,如以下几个:
1. PubMed:生物医学文献資料库,收錄了全球生物医学文献的摘要和全文。
2. GenBank:全球最大的核酸序列資料库,包含各种生物体的DNA和RNA序列。
3. BLAST:生物信息学工具,用于比對和匹配DNA、RNA和蛋白质序列。
4. PubChem:化学物质資料库,提供了大量化合物的結构、属性和生物活性信息。
5. GEO:基因表达資料库,存儲了全球各种生物体的基因表达資料。
此外,NCBI还提供了許多其他資料库和工具,如dbSNP(單核苷酸多態性資料库)、ClinVar(臨床相關變異資料库)等,用于研究基因组学、遗传学、生物信息学等领域。
总的来說,NCBI是一个重要的生物信息学資源中心,為科学研究人员、医学專業人士和生物信息学家提供了丰富的資料和工具,促进了生物学和生物医学研究的發展。如需了解更多详細信息,建議訪問NCBI官方网站或参考相關資料。
非常有用且便捷的資料库一——NCBI
常用功能:
1)查詢某个基因功能、分布、序列等。在 search 后面選择 Gene,输入需要查找的基因的名字,点擊search,查看結果。
2)primer-BLAST(/tools/primer-blast/)在設计出引物之后还在某些相应資料库中进行BLAST搜索,因此可以得到特異性引物,擴增出目的片段。用户在给出DNA模板的同时还可以限定正向引物或反向引物,这样,NCBI就只会给出另一条引物。如果用户给出了模板DNA和两条引物序列,Primer-BLAST就只会運行BLAST程式,帮助用户對引物进行分析。用户也可以只给出两条引物而不给出模板序列,这时Primer-BLAST会透過BLAST程式分析出与这對引物最匹配的模板序列。Primer-BLAST进行BLAST搜索的資料库包括RefSeq mRNA、BLAST nr和12种模式生物基因组資料库。
3)Entrez。Entrez資料库是一个整合了多个資料库的綜合检索系統,它包含了35个不同資料库的信息,共收錄有超过350,000,000条記錄(表1)。Entrez資料库支持使用简單的布尔查詢(Boolean queries)方式进行文本搜索,可以下载不同格式的資料資料,还可以按照生物学關系提供与其它相關記錄的链接。这些链接给出的都是最简要的信息,例如会给出一条序列和報道该序列的論文摘要,或者会给出一条蛋白质序列的编碼DNA序列或该蛋白质的3D結构圖。这种透過计算机運算,即基于比較序列相似性或PubMed中摘要的相似性,所给出的相關链接信息可以以最快的速度提供给用户大量的相關信息。还有一种叫做“LinkOut”的功能將这种链接功能擴展到了与外部資料库,例如各物种基因组資料库之间的链接。Entrez中搜索到的資料可以以多种格式输出,也可以打包下载或逐个下载。

✅干货|目前最全的医学文献資料库了
Pubmed是美国国家医学圖書馆(NLM)所属的国家生物技術信息中心(NCBI)于2000年4月開發的一个基于WEB的生物医学信息检索系統。它是NCBI Entrez整个資料库查詢系統中的一个。
?其資料主要来源有:MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等
?資料类型:期刊論文、綜述、以及与其它資料库。
?優点:Pubmed是免費提供生物医学方面的論文搜寻引擎2️⃣Embase
Embase(Excerpt Medica Database)是由荷兰出版大佬Elsevier Science公司建立的EM的書目型資料库。内容涉及药学、臨床医学、基礎医学、预防医学、法医学和生物医学工程等。
除了可以检索丰富的医学文献外,还支持药物和疾病检索。
3️⃣OVID
4️⃣ Cochrane library
5️⃣ Clinicalkey
6️⃣MEDLINE
7️⃣Scopus
8️⃣UpTodate
9️⃣JAMA
?中国知网
1️⃣1️⃣万方資料库(中華医学)
1️⃣2️⃣中国生物医学文献資料库(SinoMed)

强推❗医生最常用的医学网站
pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
Pubmed是美国国家医学圖書馆(NLM)所属的国家生物技術信息中心(NCBI)于2000年4月開發的一个基于WEB的生物医学信息检索系統。它是NCBI Entrez整个資料库查詢系統中的一个。其資料主要来源有:MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等。
二、EMBASE
embase.com
内容涉及药学、臨床医学、基礎医学、预防医学、法医学和生物医学工程等。除了可以检索丰富的医学文献外,还支持药物和疾病检索。
三、Cochrane libra
cochranelibrary.com
Cochrane library(考克兰圖書馆)是the Cochrane Collaboration的主要產品,目前是John Wiley & Sons国際出版社负责出版。
它包含以下6个資料库 ?
1.Cochrane Database of Systematic Review(医学保健领域系統評估的领先資源)
2.Cochrane 臨床對照實验資料库
3.Cochrane Methodology Register(介绍进行對照試验时所用方法的参考出版物)
4.Health Technology Assessment Database(衛生技術評估)
四、ClinicalKey
clinicalkey.com
臨床精鑰是信息分析公司愛思唯尔(Elsevier)推出的一个臨床决策支持工具,帮助医生快速獲取准确、简洁、世界前沿的循證医学知識。臨床精鑰包含了經本地專家参与审阅编輯的基于最新證据及實践指南的臨床綜述,并收錄了如Braunwald’s心脏病、罗森急診医学等經典圖書,涵蓋超过25000种中国臨床用药信息,并有400多种医学評分工具等
五、Clinical trials
ClinicalTrials.gov
Clinical trials(美国臨床試验資料库)是美国国立医学圖書馆(NML)与美国食品与药物管理局(FDA)在1997年開發的資料库。里面提供了网站臨床試验注册辅導,登記了各种觀察性研究和干预性研究,包括药物、器械和手術等干预方式。其注册和查詢臨床試验均為免費

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