tcga gdc

简介

TCGA (The cancer genome atlas)是一个非常重要的癌症資料库，其主要收錄各种人类癌症（包括亞型在内的肿瘤）的臨床資料，基因组變異，mRNA表达，miRNA表达，甲基化等資料，是癌症研究者很重要的資料来源。

TCGA資料库官网：https://portal.gdc.cancer.gov/

主要功能和優势

作為目前最大的癌症基因信息資料库，TCGA的全面不仅仅体现在眾多癌型上，还体现在多组学資料，包括基因表达資料、miRNA表达資料、拷貝數變異、DNA甲基化、SNP。而相對于GEO資料库，TCGA最大的優势是丰富且規范的臨床資料，以及针對每种癌型的大样本量。對于肿瘤研究者来說，TCGA資料库就是一个資源寶库，里面有很多有价值的信息可以挖掘。

TCGA資料库中正常样本數量較小或没有正常样本的肿瘤类型进行后續分析会非常受限，若繼續进行差異分析，则需要增加正常样本的數量。實際应用中常透過三种方式處理：Gtex联合分析（非正常死亡人資料）、不做Tumor_Normal差異分析、从GEO資料库找T_N資料做差異分析，差異基因在TCGA进行生存分析。

以上轉载自 : TCGA資料库官网入口网址: 学術導航

https://keyanyu.com/sites/tcga.html